El trabajo es parte de un proyecto para crear una base de datos de genomas animales de alta calidad mediante nuevas tecnologías de ensamblado.

DNAZoo es un consorcio integrado por grupos de investigación de distintos países que emplea tecnologías de secuenciación y ensamblado de última generación para generar datos genómicos de alta calidad, y cuenta entre sus integrantes a la Dra. Patricia Saragüeta, directora del laboratorio de Regulación Hormonal del Tracto Reproductivo Femenino.

Como parte de su continuo trabajo, el grupo presentó el primer genoma del proyecto ensamblado de cromosoma a cromosoma obtenido a través de una muestra argentina. Este genoma corresponde a la vizcacha, un roedor autóctono de Argentina.

“El HiC o High-Throughput Chromosome Conformation Capture (Hi-C) es una herramienta que permite mapear y cuantificar simultáneamente las interacciones entre todos los pares posibles de fragmentos de ADN dentro del núcleo. Esto nos permite dar cuenta de la probabilidad de contacto físico entre regiones distantes del genoma en su estado tridimensional para comprender mejor cómo los diferentes segmentos del genoma interactúan espacialmente entre sí”, detalla la Dra. Saragüeta, y explica que esto “proporciona una visión detallada de cómo las diferentes regiones del genoma están espacialmente relacionadas y cómo estas relaciones pueden afectar la regulación génica y la función celular en diversos contextos biológicos”.

La Dra. Patricia Saragüeta, junto los integrantes de su laboratorio Francisco Pisciottano, Clara Campos y Luciana Ant, trabajaron en el IBYME en el procesamiento de muestras y análisis bioinformático para lograr este avance por primera vez en el país.

“Contar con un genoma de alta calidad, ensamblado a nivel de cromosoma, nos permitirá conseguir un anotado de igual calidad y esto a su vez nos será sumamente útil a la hora de estudiar la asociación que existe entre las características que aparecen en la especie y la información genética que esta posee”, concluye la Dra. Saragüeta.

La información sobre este trabajo puede verse en DNAZoo.

Nota CONICET: https://www.conicet.gov.ar/especialistas-del-conicet-describen-por-primera-vez-el-genoma-de-la-vizcacha